Carbapenemase Gene PCR (Mga Bacterial Isolate at Rectal Swab)

Pangalan ng Order ng Pagsubok - Carbapenemase Gene PCR (blaKPC, blaNDM, blaVIM, blaOXA-28, blaIMP gene detection)

Mga Kasingkahulugan - Pagtuklas ng gene ng Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC); Pagtuklas ng gene ng New Delhi metallo-β-lactamase 1 (NDM-1); Pagtuklas ng gene ng Verona integron-mediated metallo-beta-lactamase (VIM); pagtuklas ng gene ng klase ng imipenemase (IMP), pagtuklas ng gene ng Class D oxacillinase (OXA-48

Metodolohiya - Real-time PCR para sa mga gene ng carbapenemase na blaKPC (KPC), blaNDM (NDM), blaVIM (VIM), blaOXA-48 (OXA-48), at blaIMP (IMP).

Mga Katanggap-tanggap na Uri ng Ispesimen para sa Pagsusuri - Mga purong bacterial isolates ng Enterobacteriaceae, Acinetobacter baumannii, o Pseudomonas aeruginosa. Mga rectal swab (tingnan ang “Transport / Collection Medium” sa ibaba).

Transportasyon / Pangongolekta -

Mga bacterial isolate: transportasyon sa nutrient agar slant, nakabalot at selyado ayon sa mga regulasyon.

Mga rectal swab: gamit ang Cepheid Collection Devices (katalog ng tagagawa #900-0370) (kilala rin bilang Copan Transystem Culture Swab Transport System).

Pag-iimbak at Preserbasyon ng Ispesimen - Ilagay sa refrigerator ang mga bacterial isolates hanggang sa maipadala sa laboratoryo; dalhin sa temperatura ng kuwarto. Ang mga rectal swab sa transport tube ay maaaring iimbak sa 15 hanggang 28°C, at dapat dalhin sa laboratoryo at subukan sa loob ng limang araw.

Minimum na Dami na Kinakailangan - Wala

Karagdagang mga Tagubilin sa Pagkolekta -

Mga Tagubilin sa Pagkuha ng Ispesimen ng Rectal Swab:

• Pagkuha ng isang pares na rectal swab: Maingat na ipasok ang magkabilang dulo ng swab nang humigit-kumulang 1 sentimetro lampas sa anal sphincter at dahan-dahang iikot. Tingnan ang Figure 1 at Figure 2 para sa mga halimbawa ng katanggap-tanggap at hindi katanggap-tanggap na mga swab.
• Ibalik ang pares ng swab sa orihinal na transport tube. Lagyan ng label ang tubo gamit ang pangalan at apelyido ng pasyente.
• Ang mga swab sa transport tube ay maaaring iimbak sa temperaturang 15 hanggang 28 °C nang hanggang limang araw. Tingnan ang Figure 1 para sa mga halimbawa ng mga katanggap-tanggap na specimen ng swab na gagamitin. Tingnan ang Figure 2 para sa mga halimbawa ng mga specimen ng swab na lubos na marumi na hindi dapat gamitin.

Karagdagang Kinakailangang Impormasyon - Isama ang mga resulta ng pagkakakilanlan at phenotypic drug sensitivity kasama ng mga isinumiteng bacterial isolate.

Ipadala? - Hindi

Oras ng Pagproseso - 2 araw ng negosyo (Lunes hanggang Biyernes)

Mga Restriksyon sa Pagsusuri -

• Ang pagganap ng assay na ito ay hindi pa nasusuri gamit ang mga specimen ng rectal swab mula sa mga batang pasyente.
• Maaaring maobserbahan ang pagkagambala sa assay na ito sa barium sulfate sa > 0.1% w/v, at Pepto-Bismol sa > 0.01% w/v sa mga pagsusuri gamit ang mga sample ng rectal swab matrix.

Mga Limitasyon / Tala / Mga Pagtatanggi -

Tinutukoy ng Xpert Carba-R Assay ang mga sequence para sa mga gene sequence ng blaKPC (KPC), blaNDM (NDM), blaVIM (VIM), blaOXA-48 (OXA-48), at blaIMP (IMP) na nauugnay sa carbapenem-non-susceptibility sa gram negative bacteria. Kasama ang mga resulta ng pagtukoy at phenotypic drug sensitivity kasama ang mga isinumiteng bacterial isolate.

Pagtatanggi: Ang PCR assay na ito ay hindi nilayon upang gabayan o subaybayan ang paggamot para sa mga impeksyon sa bakterya na hindi madaling kapitan ng carbapenem. Ang negatibong resulta ay hindi pumipigil sa pagkakaroon ng iba pang mga mekanismo ng resistensya, at ang mga resultang ito ay dapat gamitin kasabay ng iba pang mga pagsusuri sa laboratoryo kabilang ang phenotypic antimicrobial susceptibility testing. Ang ilang uri ng bakterya, tulad ng Pseudomonas aeruginosa at Acinetobacter baumannii, ay naipakita na nagpapakita ng resistensya sa mga carbapenem dahil sa mga mekanismo ng intrinsic resistance.

Na-update noong 3/5/2019