Xét nghiệm PCR gen Carbapenemase (Phân lập vi khuẩn và mẫu dịch trực tràng)

Tên đơn xét nghiệm - Xét nghiệm PCR gen Carbapenemase (phát hiện gen blaKPC, blaNDM, blaVIM, blaOXA-28, blaIMP)

Từ đồng nghĩa - Phát hiện gen carbapenemase Klebsiella pneumoniae (KPC); Phát hiện gen metallo-β-lactamase 1 New Delhi (NDM-1); Phát hiện gen metallo-beta-lactamase trung gian integron Verona (VIM); Phát hiện gen lớp imipenemase (IMP); Phát hiện gen oxacillinase lớp D (OXA-48).

Phương pháp luận - PCR thời gian thực để phát hiện các gen carbapenemase blaKPC (KPC), blaNDM (NDM), blaVIM (VIM), blaOXA-48 (OXA-48) và blaIMP (IMP).

Loại mẫu bệnh phẩm được chấp nhận để xét nghiệm - Các chủng vi khuẩn thuần khiết thuộc họ Enterobacteriaceae, Acinetobacter baumannii hoặc Pseudomonas aeruginosa. Mẫu dịch trực tràng (xem phần “Phương tiện vận chuyển/thu thập” bên dưới).

Phương tiện vận chuyển/thu gom -

Các chủng vi khuẩn phân lập: vận chuyển trên môi trường thạch dinh dưỡng dạng nghiêng, đóng gói và niêm phong theo quy định.

Lấy mẫu trực tràng: sử dụng thiết bị thu thập mẫu Cepheid (mã sản phẩm của nhà sản xuất #900-0370) (còn được gọi là Hệ thống vận chuyển mẫu cấy Copan Transystem).

Bảo quản và giữ gìn mẫu bệnh phẩm - Làm lạnh các mẫu vi khuẩn phân lập cho đến khi vận chuyển đến phòng thí nghiệm; vận chuyển ở nhiệt độ phòng. Mẫu dịch trực tràng trong ống vận chuyển có thể được bảo quản ở nhiệt độ từ 15 đến 28°C, và phải được vận chuyển đến phòng thí nghiệm và xét nghiệm trong vòng năm ngày.

Số lượng tối thiểu cần thiết - Không có

Hướng dẫn thu gom bổ sung -

Hướng dẫn thu thập mẫu dịch trực tràng:

• Thu thập mẫu dịch trực tràng bằng que tăm bông: Cẩn thận đưa cả hai đầu que tăm bông vào sâu khoảng 1 cm phía trong cơ thắt hậu môn và xoay nhẹ nhàng. Xem Hình 1 và Hình 2 để biết ví dụ về các mẫu tăm bông đạt yêu cầu và không đạt yêu cầu.
• Đặt cặp tăm bông trở lại ống đựng ban đầu. Ghi tên và họ của bệnh nhân lên ống.
• Các mẫu tăm bông trong ống vận chuyển có thể được bảo quản ở nhiệt độ từ 15 đến 28 °C trong tối đa năm ngày. Xem Hình 1 để biết ví dụ về các mẫu tăm bông đạt yêu cầu. Xem Hình 2 để biết ví dụ về các mẫu tăm bông bị bẩn nặng không nên sử dụng.

Thông tin bổ sung cần thiết - Bao gồm kết quả định danh và độ nhạy cảm thuốc theo kiểu hình cùng với các mẫu phân lập vi khuẩn.

Gửi đi? - Không

Thời gian hoàn thành - 2 ngày làm việc (Thứ Hai đến Thứ Sáu)

Hạn chế xét nghiệm -

• Hiệu quả của xét nghiệm này chưa được đánh giá bằng mẫu dịch trực tràng từ bệnh nhi.
• Có thể quan sát thấy sự nhiễu loạn trong xét nghiệm này khi sử dụng bari sulfat ở nồng độ > 0,1% w/v và Pepto-Bismol ở nồng độ > 0,01% w/v trong các thử nghiệm với mẫu dịch ngoáy trực tràng.

Hạn chế / Lưu ý / Tuyên bố miễn trừ trách nhiệm -

Xét nghiệm Xpert Carba-R phát hiện trình tự gen blaKPC (KPC), blaNDM (NDM), blaVIM (VIM), blaOXA-48 (OXA-48) và blaIMP (IMP) liên quan đến tình trạng kháng carbapenem ở vi khuẩn gram âm. Bao gồm kết quả nhận dạng và độ nhạy cảm thuốc theo kiểu hình cùng với các mẫu phân lập vi khuẩn.

Tuyên bố miễn trừ trách nhiệm: Xét nghiệm PCR này không nhằm mục đích hướng dẫn hoặc theo dõi điều trị các bệnh nhiễm trùng do vi khuẩn kháng carbapenem. Kết quả âm tính không loại trừ sự hiện diện của các cơ chế kháng thuốc khác, và các kết quả này nên được sử dụng kết hợp với các xét nghiệm khác trong phòng thí nghiệm, bao gồm cả xét nghiệm độ nhạy cảm kháng sinh kiểu hình. Một số loài vi khuẩn, chẳng hạn như Pseudomonas aeruginosa và Acinetobacter baumannii, đã được chứng minh là có khả năng kháng carbapenem do các cơ chế kháng thuốc nội tại.

Cập nhật ngày 3/5/2019