INFORME

Secuenciación del genoma completo de la COVID-19

San Francisco Public Health Laboratory

Nombre de la orden de prueba: secuenciación del genoma completo del SARS-COV-2

Sinónimo(s) - COVID-19 WGS

Metodología - Clear Labs

Tipos de muestra aceptables para la prueba: nasofaríngea (NP), lavado nasofaríngeo, orofaríngea (OP), aspirado traqueal, esputo, fosas nasales anteriores, líquido pleural, cornete medio nasal, lavado broncoalveolar (BAL), aspirado nasal

Medio de transporte/recolección : medio de transporte universal o viral, solución salina, RNAshield, kit de recolección Aptima

Almacenamiento y conservación de la muestra : Congele la muestra original o el extracto a -70 °C dentro de las 48 horas posteriores a la recolección.

Volumen mínimo requerido : 1 mililitro para la muestra original. 40 microlitros para el extracto.

Instrucciones adicionales para la recolección : Congele las muestras a -70 °C y envíelas en hielo seco, de acuerdo con las regulaciones del Departamento de Transporte (DoT) y la IATA sobre sustancias biológicas, categoría B (ONU 3373), de lunes a jueves. Las muestras también pueden enviarse por mensajería de lunes a viernes, de 8:00 a 17:00.

Información adicional requerida : fecha de recolección, valor CT/CN o RLU, identificación de la muestra de laboratorio enviada, nombre completo y fecha de nacimiento (DOB) del paciente, tipo de muestra.

¿Enviar? - No

Tiempo de entrega : 7 días

Restricciones de prueba: Envíe muestras positivas de COVID-19 que tengan resultados de valores CT/CN menores o iguales a 28 y muestras de Aptima con resultados de RLU mayores o iguales a 1100

Limitaciones / Notas / Descargo de responsabilidad : Esta prueba WGS no ha sido validada para uso diagnóstico. Estos resultados son solo para fines de salud pública. Los resultados de la WGS no se informarán a los profesionales sanitarios ni a los pacientes, ni deberán incluirse en la historia clínica del paciente. Para obtener información sobre las variantes y sus proporciones, visite el sitio web de los CDC: https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant proportions.html . Los resultados de linaje se enviarán a CalREDIE.