Phát hiện nhanh chóng khả năng kháng thuốc của phức hợp vi khuẩn Mycobacterium tuberculosis (Phương pháp giải trình tự Pyrosequencing)

Tên đơn xét nghiệm - Vi khuẩn Mycobacterium tuberculosis phức hợp: Phát hiện phân tử khả năng kháng thuốc (Xét nghiệm được chuyển đến MDL-CDPH)

Từ đồng nghĩa - Giải trình tự Pyrosequencing (PSQ) để xác định các đột biến liên quan đến kháng thuốc.

Phương pháp luận - Giải trình tự Pyrosequencing (PSQ) được thực hiện để xác định các đột biến liên quan đến kháng thuốc trong các gen sau: rpoB đối với rifampin, katG, vùng khởi động inhA và ahpC đối với isoniazid, gyrA đối với fluoroquinolone, và rrs đối với các thuốc tiêm như amikacin, capreomycin hoặc kanamycin.

Loại mẫu vật được chấp nhận để xét nghiệm - Mẫu trầm tích hoặc mẫu nuôi cấy.

Môi trường vận chuyển/thu thập mẫu - Lọ thu thập mẫu vô trùng hoặc môi trường nuôi cấy lỏng (MGIT) hoặc rắn (LJ Slant).

Bảo quản và giữ gìn mẫu vật - Trầm tích: làm lạnh ở 4°C. Nuôi cấy: Ủ (35 đến 37°C), trước khi vận chuyển ở nhiệt độ phòng hoặc đóng gói lạnh.

Thể tích tối thiểu cần thiết - 0,5 mililit cặn

Hướng dẫn thu thập mẫu bổ sung - Cần có chủng M.tb. tươi, tinh khiết để thực hiện xét nghiệm này. Việc xác định chủng M.tb. phải được xác nhận trước khi tiến hành xét nghiệm.

Thông tin bổ sung cần thiết - Ngày lấy mẫu và nguồn mẫu bệnh phẩm. Ghi rõ kết quả xét nghiệm độ nhạy cảm với thuốc điều trị đầu tay và tiền sử bệnh của bệnh nhân. Cần có sự chấp thuận trước từ Phòng thí nghiệm bệnh truyền nhiễm (MDL).

Gửi đi? - Có

Thời gian hoàn thành - 1 đến 3 ngày

Hạn chế xét nghiệm - Không có

Hạn chế / Lưu ý / Tuyên bố miễn trừ trách nhiệm - Phải có đủ số lượng vi khuẩn M.tb. để cho kết quả chấp nhận được. Mẫu bệnh phẩm có ít nhất 0,5 mililit và nhuộm dương tính với acid-fast từ 1+ trở lên rất có khả năng cho kết quả chấp nhận được. Đôi khi các chất ức chế trong mẫu bệnh phẩm có thể ngăn cản quá trình khuếch đại DNA và giải trình tự pyrosequencing thành công.